Здесь будет эмблема,извините за недоработку

Третий семестр

Pymol

Задание

В белке 1IHF 2 цепи. Согласно DSSP в белке Альфа-спиралей 3 в цепи A и 3 в цепи B
Бета-тяжей 5 в A цепи и 5 в B цепи. Согласно записи PDB количество элементов вторичной структуры тоже. их позиции совпадают с найденными DSSP
остатки, имеющие положительное значение угла phi:

17 Gly A
41 Gly A
48 Gly A
50 Gly A
68 Gly A
40 Gly B
47 Gly B
50 Gly B
67 Gly B

Остовная модель цепи A. Красные Альфа-спирали Зеленые Бета тяжи и отмечены глицины с полож углом фи.

Остаток gly17 цепи A

Водородные связи

Атомы между котороми водородная связь отмечены.
Связь между остовными атомами цепи

Связь между атомами боковой цепи

Связь между остовным азотом Глутамина и кислородом боковой цепи Треонина.

Водяной мостик

Водородная

Главная

Второй Семестр