Для поиска гомологов была выбрана программа blastx, так как пробная последовательность содержала нуклеотидную последовательность, банк данных содержал аминокислотную последовательность. использовалась команда formatdb -i salty_proteome.fasta -p t -n sp для создания индексных файлов и команда blastall -p blastx -d sp -i a.fasta -e 0.001 -o out для поиска гомологов, где a.fasta - это выданный участок длиной 4000 нуклеотидов (для его создания использована команда seqret -sask и введены нужные параметры начала последовательности, её конца и то, что цепь прямая). Близкие гомологи были найдены в SRS, где была установлена связь с документами EMBL, в полученном документе было обнаружено, что ген c ID Q8ZJW8 расположен в секции 38 из 220, а ген Q8ZP31 - в секции 218 из 220. Расположение генов можно точнее посмотреть ниже:
Гипотетические гены во фрагменте 42001-46000
3'--[<=gene Q8ZJ8, 1021-1542]---------------------------------5'
5'--------------------------------[=>gene Q8ZP31, 2668-3999]--3'