Чтобы проверить правильность построенного дерева по рРНК, построим дополнительное дерево с рибосомным белком S12 (RS12), вместо ЕFTS.
выравнивание
fprotpars -sequence rs12_al.fasta -outfile rs12.fprotpars
скобочная формула дерева (rs12_al.treefile):
((((RS12_GEOKA,RS12_BACSU),(RS12_ENTFA,(RS12_LACDA,RS12_LACAC))),(RS12_CLOTE,RS12_CLOB1)),RS12_FINM2);
Это дерево такое же, как дерево, построенное по EFTS, соответственно, где-то ошибка в дереве, построенном по рРНК.