ID   SEQUENCE_PROFILE; MATRIX.
AC   ZZ99999;
DT   Thu May 19 10:36:19 2011
DE   Generated from MSF file: 'pat_pfw.msf'.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=22;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=20;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0000000; R2=0.0100000; TEXT='No_units';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=850; N_SCORE=8.5000000; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=650; N_SCORE=6.5000000; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=40,-20,0,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-20,-10,-10,-10,10,0,0,-30,-20,-10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,-10,10,-30,-20,-10,-30,50,-20,-10,0,-10,10,20,0,-10,-20,-30,-20,10;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-26,-18,-2,-28,-20,-4,-26,14,-18,-10,0,-18,6,39,-6,1,-24,-28,-20,-2;
MA   /M: SY='T'; M=3,-7,-10,-7,-7,-20,-14,-17,-13,-7,-13,-10,3,-10,-7,-10,19,38,-6,-23,-20,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-30,2,-12,-30,43,-15,-37,-16,-39,-29,9,-19,-15,-18,1,-16,-30,-25,-29,-13;
MA   /M: SY='A'; M=34,-21,-1,-21,-11,-19,-4,-21,-4,-11,-7,-7,-21,-11,-11,-13,6,0,6,-30,-19,-11;
MA   /M: SY='K'; M=-7,6,-29,6,20,-28,-16,-8,-27,22,-24,-15,2,-10,9,4,6,-3,-19,-30,-21,16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-10,-30,-22,-8,-32,-30,32,-22,12,10,-30,-22,-22,-30,-20,-2,38,-30,-10,-22;
MA   /M: SY='S'; M=16,-4,-8,-4,-2,-20,0,-12,-18,-2,-18,-10,4,-10,-2,-10,34,8,-16,-30,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,60,-20,-40,-20,-40,-30,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-20,-20,70,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-10,-30,-26,-4,-36,-30,36,-26,16,10,-30,-26,-26,-30,-20,-6,34,-30,-10,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-20,-20,70,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-40,-10,-40,-30,0,-40,-30,20,-20,40,20,-30,-30,-20,-20,-20,-10,10,-20,-10,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-20,-20,70,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,10,50,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-39,25,46,-30,-19,-1,-30,8,-31,-21,1,-10,18,-2,0,-10,-21,-31,-21,36;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-15,5,-30,-20,-5,-30,36,-20,-10,0,-15,10,34,-5,-10,-25,-30,-20,5;
MA   /M: SY='S'; M=-2,6,-18,11,7,-23,-11,-12,-20,-4,-22,-15,5,-10,0,-11,17,16,-15,-29,-22,4;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-33,-10,-33,-25,-5,-35,-30,30,-23,21,13,-30,-25,-23,-27,-20,-5,29,-27,-10,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-30,-17,-30,-23,24,-31,-2,6,-23,0,-2,-25,-30,-18,-25,-20,-15,5,2,37,-23;
MA   /M: SY='T'; M=0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,10,50,0,-20,-20,-10;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /GENERATED_BY="pfmake pat_pfw.msf /usr/share/pftools23/blosum62.cmp";
//