Fine Packing Quality Control The packing quality control per amino acid: Date= 2012-04-18 16:18:36 ----Residue------- State AllAll BB-BB BB-SC SC-BB SC-SC --------------------------------------------------------------------------- 1 MET ( 1 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 2 LYS ( 2 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 3 VAL ( 3 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 4 SER ( 4 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 5 GLN ( 5 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 6 ASN ( 6 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 7 GLY ( 7 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 8 LEU ( 8 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 9 ASN ( 9 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 10 LEU ( 10 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 11 ILE ( 11 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 12 LYS ( 12 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 13 GLU ( 13 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 14 PHE ( 14 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 15 GLU ( 15 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 16 GLY ( 16 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 17 CYS ( 17 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 18 ARG ( 18 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 19 LEU ( 19 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 20 THR ( 20 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 21 ALA ( 21 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 22 TYR ( 22 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 23 LYS ( 23 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 24 PRO ( 24 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 25 VAL ( 25 ) A 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 26 PRO ( 26 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 27 TRP ( 27 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 28 GLU ( 28 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 29 GLN ( 29 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 30 MET ( 30 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 31 TYR ( 31 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 32 THR ( 32 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 33 ILE ( 33 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 34 GLY ( 34 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 35 TRP ( 35 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 36 GLY ( 36 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 37 HIS ( 37 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 38 TYR ( 38 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 39 GLY ( 39 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 40 VAL ( 40 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 41 THR ( 41 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 42 ALA ( 42 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 43 GLY ( 43 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 44 THR ( 44 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 45 THR ( 45 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 46 TRP ( 46 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 47 THR ( 47 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 48 GLN ( 48 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 49 ALA ( 49 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 50 GLN ( 50 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 51 ALA ( 51 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 52 ASP ( 52 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 53 SER ( 53 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 54 GLN ( 54 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 55 LEU ( 55 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 56 GLU ( 56 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 57 ILE ( 57 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 58 ASP ( 58 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 59 ILE ( 59 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 60 ASN ( 60 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 61 ASN ( 61 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 62 LYS ( 62 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 63 TYR ( 63 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 64 ALA ( 64 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 65 PRO ( 65 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 66 MET ( 66 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 67 VAL ( 67 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 68 ASP ( 68 ) A 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 69 ALA ( 69 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 70 TYR ( 70 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 71 VAL ( 71 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 72 LYS ( 72 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 73 GLY ( 73 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 74 LYS ( 74 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 75 ALA ( 75 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 76 ASN ( 76 ) A 1 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 77 GLN ( 77 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 78 ASN ( 78 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 79 GLU ( 79 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 80 PHE ( 80 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 81 ASP ( 81 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 82 ALA ( 82 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 83 LEU ( 83 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 84 VAL ( 84 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 85 SER ( 85 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 86 LEU ( 86 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 87 ALA ( 87 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 88 TYR ( 88 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 89 ASN ( 89 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 90 CYS ( 90 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 91 GLY ( 91 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 92 ASN ( 92 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 93 VAL ( 93 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 94 PHE ( 94 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 95 VAL ( 95 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 96 ALA ( 96 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 97 ASP ( 97 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 98 GLY ( 98 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 99 TRP ( 99 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 100 ALA ( 100 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 101 PRO ( 101 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 102 PHE ( 102 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 103 SER ( 103 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 104 HIS ( 104 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 105 ALA ( 105 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 106 TYR ( 106 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 107 CYS ( 107 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 108 ALA ( 108 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 109 SER ( 109 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 110 MET ( 110 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 111 ILE ( 111 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 112 PRO ( 112 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 113 LYS ( 113 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 114 TYR ( 114 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 115 ARG ( 115 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 116 ASN ( 116 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 117 ALA ( 117 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 118 GLY ( 118 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 119 GLY ( 119 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 120 GLN ( 120 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 121 VAL ( 121 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 122 LEU ( 122 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 123 GLN ( 123 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 124 GLY ( 124 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 125 LEU ( 125 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 126 VAL ( 126 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 127 ARG ( 127 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 128 ARG ( 128 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 129 ARG ( 129 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 130 GLN ( 130 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 131 ALA ( 131 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 132 GLU ( 132 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 133 LEU ( 133 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 134 ASN ( 134 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 135 LEU ( 135 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 136 PHE ( 136 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 137 ASN ( 137 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 138 LYS ( 138 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 139 PRO ( 139 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 140 VAL ( 140 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 141 SER ( 141 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 142 SER ( 142 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 143 ASN ( 143 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 144 SER ( 144 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 145 ASN ( 145 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 146 GLN ( 146 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 147 ASN ( 147 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 148 ASN ( 148 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 149 GLN ( 149 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 150 THR ( 150 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 151 GLY ( 151 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 152 GLY ( 152 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 153 MET ( 153 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 154 ILE ( 154 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 155 LYS ( 155 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 156 MET ( 156 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 157 TYR ( 157 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 158 LEU ( 158 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 159 ILE ( 159 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 160 ILE ( 160 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 161 GLY ( 161 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 162 LEU ( 162 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 163 ASP ( 163 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 164 ASN ( 164 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 165 SER ( 165 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 166 GLY ( 166 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 167 LYS ( 167 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 168 ALA ( 168 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 169 LYS ( 169 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 170 HIS ( 170 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 171 TRP ( 171 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 172 TYR ( 172 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 173 VAL ( 173 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 174 SER ( 174 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 175 ASP ( 175 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 176 GLY ( 176 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 177 VAL ( 177 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 178 SER ( 178 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 179 VAL ( 179 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 180 ARG ( 180 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 181 HIS ( 181 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 182 VAL ( 182 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 183 ARG ( 183 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 184 THR ( 184 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 185 ILE ( 185 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 186 ARG ( 186 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 187 MET ( 187 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 188 LEU ( 188 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 189 GLU ( 189 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 190 ASN ( 190 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 191 TYR ( 191 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 192 GLN ( 192 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 193 ASN ( 193 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 194 LYS ( 194 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 195 TRP ( 195 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 196 ALA ( 196 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 197 LYS ( 197 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 198 LEU ( 198 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 199 ASN ( 199 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 200 LEU ( 200 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 201 PRO ( 201 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 202 VAL ( 202 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 203 ASP ( 203 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 204 THR ( 204 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 205 MET ( 205 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 206 PHE ( 206 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 207 ILE ( 207 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 208 ALA ( 208 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 209 GLU ( 209 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 210 ILE ( 210 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 211 GLU ( 211 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 212 ALA ( 212 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 213 GLU ( 213 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 214 PHE ( 214 ) A 2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 215 GLY ( 215 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 216 ARG ( 216 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 217 LYS ( 217 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 218 ILE ( 218 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 219 ASP ( 219 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 220 MET ( 220 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 221 ALA ( 221 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 222 SER ( 222 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 223 GLY ( 223 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 224 GLU ( 224 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 225 VAL ( 225 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 226 LYS ( 226 ) A 3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 All contacts : Average = 0.000 Z-score = -0.06 BB-BB contacts : Average = 0.000 Z-score = -0.10 BB-SC contacts : Average = 0.000 Z-score = -0.09 SC-BB contacts : Average = 0.000 Z-score = 0.11 SC-SC contacts : Average = 0.000 Z-score = 0.21 If an individual residue has a quality control value of -2.5 or worse, you should take a look at it. It can mean that the residue: is involved in symmetry contacts, or is binding a co-factor, ligand or ion, or is an active site residue, or is wrong. Average protein values ("Z-score for all contacts") can be read as follows: -5.0 Guaranteed wrong structure. Bad structure or poor model -3.0 Probably bad structure or unrefined model. Doubtful structure or model -2.0 Structure OK or good model. Good structures 0.0 Good structures. 2.0 Good structures. Unusually Good structures 4.0 Probably a strange model of a perfect helix