Практикум 3: рассеяние на кристалле, разрешение гармоники, разрешение структуры, фазовая проблема
- Статья про 1HQS
-
Табличная информация о гомологах 1HQS, полученная с помощью BLAST
Гомологи, найденные BLAST:
  Advanced на сайте RCSB PDB -> Запрос по последовательность с помощью BLAST:
Custom Report.xls
-
Краткое описание белка 1HQS
a. Главный биологический результат статьи: была определена кристаллическая структура изоцитрат дегидрогеназы из Bacillus
subtilis и проведено тщательное сравнение с ее гомологом из Escherichia coli.
b. Разрешение структуры: 1,55Å
c. Фазовая проблема решена с помощью метода молекулярного замещения
d. 114794 структурных факторов измерено и 114793 (99,99%) имеют силу сигнала более 3,0
e. R-фактор (R-cryst) = 22,7%; R-free фактор = 28,1%
f. Источники:
Статья
RCSB PDB
EDS
g. Bыравнивание полной последовательности белка (из Uniprot) и белка,
представленного в PDB файле с помощью JalView:
© Anastasia Maslova, 2012