Практикум 3: рассеяние на кристалле, разрешение гармоники, разрешение структуры, фазовая проблема

  1. Статья про 1HQS
  2. Табличная информация о гомологах 1HQS, полученная с помощью BLAST

    Гомологи, найденные BLAST:
        Advanced на сайте RCSB PDB -> Запрос по последовательность с помощью BLAST:
    Custom Report.xls
  3. Краткое описание белка 1HQS

    a. Главный биологический результат статьи: была определена кристаллическая структура изоцитрат дегидрогеназы из Bacillus subtilis и проведено тщательное сравнение с ее гомологом из Escherichia coli.
    b. Разрешение структуры: 1,55Å
    c. Фазовая проблема решена с помощью метода молекулярного замещения
    d. 114794 структурных факторов измерено и 114793 (99,99%) имеют силу сигнала более 3,0
    e. R-фактор (R-cryst) = 22,7%; R-free фактор = 28,1%
    f. Источники:
        Статья
        RCSB PDB
       
    EDS
    g. Bыравнивание полной последовательности белка (из Uniprot) и белка, представленного в PDB файле с помощью JalView:




© Anastasia Maslova, 2012