Для скачивания скрипта нажмите на ссылку
| Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O () |
| Альфа-спирали | ||
| N(025TRP)-O(022ARG) | 3.07 | 137.9 |
| N(024TYR)-O(021SER) | 2.91 | 153.1 |
| N(025ASP)-O(022ARG) | 2.92 | 144.5 |
| Среднее | 2.94 | 145.16 |
| Бета-листы | ||
| N(068VAL)-O(055PHE) | 2.78 | 162.4 |
| N(070ILE)-O(053GLU) | 2.82 | 154.4 |
| N(057ALA)-O(066ALA) | 2.87 | 157.5 |
| Среднее | 2.82 | 158.23 |
По данным таблицы видно,что средняя длина водородной связи равна 2,96Å в альфа-спиралях составляет 2,96Å и 2.82Å в бета-тяжах. Средний угол N-H-O в альфа-спирали - 145.165 градусов, в бета-тяжах - 158.13 градусов. Средние значения не противоречат даным из литературого источника.[1]
[1] Baker, E. N., & Hubbard, R. E. (1984). Hydrogen bonding in globular proteins. Progress in Biophysics and Molecular Biology, 44