Практикум 1. Филогенетическое дерево.

Задание 1

Таблица 1. Отобранные бактерии.

Название Мнемоника
Acidothermus cellulolyticus ACIC1
Bifidobacterium longum BIFLO
Corynebacterium diphtheriae CORDI
Leifsonia xyli LEIXX
Mycobacterium tuberculosis MYCTU
Nocardioides sp. NOCSJ
Rubrobacter xylanophilus RUBXD
Thermobifida fusca THEFY

Скобочная формула дерева

(((((ACIC1, THEFY), NOCSJ), (BIFLO, LEIXX)), (CORDI, MYCTU)), RUBXD);

Изображение дерева

Дерево
Рис. 1 Филогенетическое дерево

Ветви дерева

Дерево содержит пять нетривиальных ветвей:

1) {CORDI, MYCTU} против {ACIC1, THEFY, NOCSJ, BIFLO, LEIXX, RUBXD}

2) {CORDI, MYCTU, RUBXD} против {ACIC1, THEFY, NOCSJ, BIFLO, LEIXX}

3) {BIFLO, LEIXX} против {ACIC1, THEFY, NOCSJ, CORDI, MYCTU, RUBXD}

4) {CORDI, MYCTU, RUBXD, BIFLO, LEIXX} против {ACIC1, THEFY, NOCSJ}

5) {CORDI, MYCTU, RUBXD, BIFLO, LEIXX, NOCSJ} против {ACIC1, THEFY}

Таксоны, соответствующие нетривиальным ветвям

{CORDI, MYCTU} - порядок Mycobacteriales

{ACIC1, THEFY, NOCSJ, BIFLO, LEIXX, CORDI, MYCTU} - отдел Actinobacteria