Пример гидрофобного контакта
|
|
Остаток фениаланина с наибольшим числом гидрофобных контактов.
Представлен в шарнирной модели, в подписи указан # остатка,
Контактирующие с ним а.о представлены в шарнирной модели, атомы в виде шариков среднего размера.
Все атомы раскрашены по химическим элементам.
|
Примеры водородных связей между боковыми группами
|
|
Донором и акцептором водорода являются атомы кислорода.
(Предполагается, что есть водородная связь, если расстояние между донором и акцептором водорода не более, чем 3,5 Å).
|
Примеры водородных связей между боковыми группами
|
|
Донором и акцептором водорода являются атомы азота.
(Предполагается, что есть водородная связь, если расстояние между донором и акцептором водорода не более, чем 3,5 Å).
В RSGA_BACSU наименьшее расстояние между азотами боковой цепи 3,58 Å. Можно с большой долей уверенности сказать, что
между ними есть водородная связь.
(зеленым цветом обозначен остов)
|
Пример дисульфидного мостика
|
|
Пример дисульфидного мостика в инсулине.
В RSGA_BACSU дисульфидные мостики не встречаются.
(дисульфидная связь выделена зеленным цветом)
|