Practice 11
PSI-BLAST
Для E-value установлен порог 0,005.
ID белка
AC белка
Число итераций
Для первой итерации
Для последней итерации
Число находок выше порога (
0,005
)
Худшее E-value выше порога
Лучшее E-value ниже порога
Число находок выше порога (
0,005
)
Худшее E-value выше порога
Лучшее E-value ниже порога
RSGA_BACSU
O34530
226
2e-20
0.011
MINC_ECOLI
P18196
6
162
0.005
0.006
882
0.001
0.051
SSRP_ECOLI
P0A832
2
514
3e-10
5.4
514
5e-31
0.35
RP5M_RHIME
P17265
4
15
0.005
0.12
25
8e-15
0.025
Для E-value установлен порог 0,001.
ID белка
AC белка
Число итераций
Для первой итерации
Для последней итерации
Число находок выше порога (
0,001
)
Худшее E-value выше порога
Лучшее E-value ниже порога
Число находок выше порога (
0,001
)
Худшее E-value выше порога
Лучшее E-value ниже порога
MINC_ECOLI
P18196
3
155
0.001
0.001
188
3e-10
0.001
RSGA_BACSU
O34530
3
226
2e-20
0.011
2979
0,001
0,001
Для белка RSGA_BACSU не удалось провести более трех итераций. После трех итераций большая часть находок была с пометкой "NEW"( более 2000 новых находок ).