В определенном мне наименовании файла pdb опечатка. 1U01.pdb - включает в себя две коротких цепи нуклеотидов(по 6 в каждой). Я предположил, что нужный мне файл называется 1U0L.pdb.
Задание 1
У немутировавшего белка на данной позиции стоит изолейцин.
Сверху изображен(Rasmol) участок белка 1T9H. Интересующий нас аминокислотный остаток(выделен зеленым цветом) входит в состав тяжа. Аминокислота, находящаяся на данной позиции в выравнивании, является структурообразующей.
На рисунке сверху изображены водородные связи образованные аминокислотным остатком в немутировавшем белке.
Вывод: учитывая вышесказанное, можно мредположить, что мутация, которая привела к замене изолейцина на лизин, окажется нежизнеспособной. Скорее всего, она приведет к нарушению структуры белка.
Задание 2
Можно с большой долей уверенности сказать, что участок выравнивания с 181 по 192 позицию правильный.
Визуализация файла gordeyev_1t9h_1u0l.ent
Name: 1t9h_A Len: 307 Check: 4106 Weight: 1.00
Name: 1u0l_B Len: 307 Check: 9335 Weight: 1.00
Name: GC Len: 307 Check: 5796 Weight: 1.00
Name: AGC1 Len: 307 Check: 1028 Weight: 1.00
Координаты участков выравнивания, на которых оно подтверждается структурными данными
12-16
22-24
52-58
84-89
105-116
150-155
173-179
217-220
224-236
275-301
