Текст скрипта доступен по ссылке
| Параметры водородных связей между остовными атомами азота и кислорода | |||
|---|---|---|---|
| # | Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (°) |
| Альфа-спирали | |||
| 1 | O(25GLU) - N(29LYS) | 3.03 | 153.0 |
| 2 | O(27ALA) - N(31LYS) | 2.73 | 151.8 |
| 3 | O(26GLU) - N(30VAL) | 2.86 | 156.9 |
| 4 | O(22ASP) - N(26GLU) | 2.91 | 163 |
| Средние значения | 2.88 | 156.2 | |
| Бета-тяжи | |||
| 1 | O(17TYR) - N(153LEU) | 2.83 | 174.7 |
| 2 | O(153LEU) - N(19LYS) | 2.92 | 149.9 |
| 3 | O(151VAL) - N(17TYR) | 2.91 | 157.0 |
| 4 | O(152TYR) - N(124ALA) | 2.87 | 153.5 |
| Средние значения | 2.88 | 158.8 | |
Среднее значение длины водородной связи между остовными атомами азота и кислорода в альфа-спирали и бета-листах составляет составляет 2.88Å.Полученные данные соответствуют стандартным значениям длин связи, согласно данным из литературных источников(2.7-3.0 Å[1]; 2.99±0.14 Å для альфа-спиралей и 2.91±0.14 Å для бета-листов[2].
Среднее значение углов N-H-O соответствует норме(15511 для альфа-спиралей и 16010 для бета-тяжей[2]). Водородные связи с такими углами можно считать водородными связями средней силы[3].