Множественное выравнивание. Эволюционные домены белков

Домен. Проект Jalview

Для выполнения задания был выбран домен CRISPR Cas6 N-terminal domain.
Информация о домене:

Проект Jalview можно скачать по ссылке

Нахождение блоков

1. Вертикальный плюс-блок
Паттерн плюс-блока: [DE][KR]AF[TS][ILV]SP[LIV]Q[ILVM], колонки 50-60, в красной рамке. Паттерн был составлен c учетом свойств аминокислот: в квадратные скобки выделялись аминокисслоты со схожими свойствами (отрицательно и положительно заряженные, полярные незаряженные, неполярные гидрофобные).
2. Частичный плюс-блок
Паттерн частисного плюс-блока: PIPKKPT, колонки 87-93, в фиолетовой рамке.
3. Минус-блок
Паттерн отсутсвует, колонки 102-105, в черной рамке.