Филогенетическое дерево, pr1


Отобранные бактерии


Streptomyces avermitilis (STRAW)
Leifsonia xyli (LEIXX)
Clavibacter michiganensis (CLAMS)
Bifidobacterium longum (BIFLO)
Mycobacterium leprae (MYCLE)
Mycobacterium tuberculosis (MYCTU)
Corynebacterium efficiens (COREF)
Rubrobacter xylanophilus (RUBXD)


Скобочная формула дерева


(((((LEIXX,CLAMS),BIFLO),STRAW),((MYCLE,MYCTU),COREF)),RUBXD);


Изображение дерева



Ветви дерева


Дерево содержит следующие нетривиальные ветви:

{LEIXX, CLAMS} против {BIFLO, STRAW, MYCLE, MYCTU, COREF, RUBXD}
{LEIXX, CLAMS, BIFLO} против {STRAW, MYCLE, MYCTU, COREF, RUBXD}
{LEIXX, CLAMS, BIFLO, STRAW} против {MYCLE, MYCTU, COREF, RUBXD}
{LEIXX, CLAMS, BIFLO, STRAW, RUBXD} против {MYCLE, MYCTU, COREF}
{LEIXX, CLAMS, BIFLO, STRAW, RUBXD, COREF} против {MYCLE, MYCTU}



Реконструкция филогении, pr2


bacteria taxonomy
Streptomyces avermitilis cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Kitasatosporales; Streptomycetaceae; Streptomyces
Leifsonia xyli cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia
Clavibacter michiganensis cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Clavibacter
Bifidobacterium longum cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Bifidobacteriales; Bifidobacteriaceae; Bifidobacterium
Mycobacterium leprae cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Mycobacterium tuberculosis cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium; Mycobacterium tuberculosis complex
Corynebacterium efficiens cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium
Rubrobacter xylanophilus cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Rubrobacteria; Rubrobacterales; Rubrobacteraceae; Rubrobacter

Все бактерии, кроме Rubrobacter xylanophilus, относятся к классу Actinomycetes. Все листья из нетривиальной ветви {MYCLE, MYCTU, COREF} относятся к порядку Mycobacteriales. Ветвь {LEIXX, CLAMS} выделяет семейство Microbacteriaceae.