Геранилгеранил редуктаза (id: 3ATQ)

**рис.1** Геранилгеранил редуктаза, общий вид белка (раскраска по индексу цепи)

Геранилгеранилредуктаза - белок (фермент), содержащий в структуре 1 полимерную цепь (цепь A) (биологическая единица также представлена этой единственной цепью). В структуре можно выделить 3 домена: FAD-связывающий, каталитический и C-концевой.

Цепь A

Данная цепь транслируется у археи Sulfolobus acidocaldarius. Полное систематическое положение:

Archaea > Thermoproteati > Thermoproteota > Thermoprotei > Sulfolobales > Sulfolobaceae > Sulfolobus > Sulfolobus acidocaldarius

uniprot_id: Q4JA33

Название: Дигеранилгеранилглицерофосфолипид-редуктаза

**рис.2** Представленность типов вторичной структуры в геранилгеранил редуктазе

Функции: участвует в воостановлении 2,3-дигеранилгеранилглицерофосфолипидов (ненасыщенных археолов) до 2,3-дифитанил глицерофосфолипидов (насыщенных археолов) в процессе синтеза архейных липидов, слагающих клеточную мембрану. Катализирует образование архетидной кислоты из 2,3-диоксигеранилгеранилглицеролфосфата путем воостановления каждой двойной связи изопреноидной цепи. Не активен с NADPH или NADH в качестве донора электронов; физиологический восстановитель неизвестен. Также катализирует реакции, в которых участвуют более ранние предшественники в синтезе мембранных липидов: полное воостанавление 3-оксигеранилгеранилглицерилфосфата до 3-оксифитанилглицерилфосфата и частичное восстановление геранилгеранилдифосфата до фитилдифосфата (восстановление 3 из 4 двойных связей сохранение аллильной двойной связи). Продукт этой реакции - высокоактивный донор пренильных групп, которые могут быть использованы как субстрат для архейных пренилтрансфераз.

В последовательности отсутствуют мутации относительно референса из Uniprot (см. рис.3).

**рис.3** Выравнивание последовательностей белка из баз данных PDB и UniProtKB

Модифицированных аминокислотных остатков нет.

Структура белка в большей степени представлена альфа-спиралями (см. рис.2).

Малые молекулы

FDA — дигидрофлавин-аденин динуклеотид (dihydroflavine-adenine dinucleotide) — заходит в активный сайт фермента. Обеспечивает перенос электрона на молекулу липида (т.е. является восстановителем в катализируемой ферментом реакции).

C14 — тетрадекан (tetradecane) — молекула не связана с функциями, выполняемыми белком. Иллюстрирует положение субстрата при катализе.

**рис.4** Положение малых молекул в структуре белка (оранжевый - FDA, синий - C14)

**рис.5** Аминокислотное окружение C14 (слева) и FDA (участка, прилежащего к активному центру) (справа) в радиусе 5 ангстрем