Правило образования водородных связей в альфа-спирали:
Атом кислорода из остовной цепи остатка с номером n образует водородную связь
с амидным водородом остовной цепи остатка с номером n+4 Водородные связи альфа-спирали изолейцин498-аргинин517 цепи А
Водородные связи 498-517 c остальной структурой белка
Крупными красными и синими шариками показаны соответственно атомы кислорода и азота боковых цепей альфа спирали 498-517, тонкими красными и синими палочками - атомы кислорода и азота остальной структуры, находящиеся в пределах 3.7 ангстрем от альфа-спирали. Бледно-серым - атомы белка в пределах 10 ангстрем от альфа-спирали. Гидрофобные связи 498-517 с остальной структурой белка
Крупными зелёными шариками показаны неполярные атомы боковых цепей альфа спирали 498-517, тонкими красными (углерод) и жёлтыми (сера) палочками - неполярные атомы боковых цепей остальной структуры, находящиеся в пределах 3.7 ангстрем от альфа-спирали. Бледно-серым - атомы белка в пределах 10 ангстрем от альфа-спирали. |