Характеристики PDB-файла; биологические единицы

 
Характеристики записи PDB 1FL2: 
1)Разрешение 1,9 A
2)Число рефлексов 29484
3)Полнота (процент рефлексов с разрешением ниже указанного) 99,6%
4)R-фактор 0,197
5)Свободный R-фактор 0,217
- процент рефлексов, использованных для его вычисления 4,9%
6)Кристаллографическая группа и тип симметрии P322 
7)Длины векторов a, b, c (базисных периодов кристаллической решётки) 60,440 60,440 171,830
8)Ортогональны ли базисные периоды? нет
9)Совпадает ли абсолютная система координат с депонируемой (используемой в записи PDB)? да
10)Совпадает ли биологическая единица с ассимметрической единицей, записанной в файле? да
11)Есть ли в структуре атомы с коэффициентом заполнения, меньшим 1? нет

Относительные координаты атома CA изолейцина-498, вычисленные по матрице, приведённой ниже: 
9.387  23.720  -0.702  ---> 0.155 0.543 -0.004

        
 
SCALE1      0.016545  0.009552  0.000000        0.00000                         
SCALE2      0.000000  0.019105  0.000000        0.00000                         
SCALE3      0.000000  0.000000  0.005820        0.00000 


С сервера PDBe я скачала файл с биологической единицей записи 1BDH.
В то время, как стандартная запись ассиметрической единицы в PDB содержит только одну цепь ДНК и мономер связанного
с ней белка, изображение биологической единицы даёт представление о реальном устройстве комплекса.

ассиметрическая единица 



биологическая единица