Задание 1
| Название белка | ID | E-value | Query cover, % | Identity, % | Гомология |
| Sialidase | Q02834.1 | 3e-110 | 58 | 44 | да |
| Sialidase | P31206.2 | 3e-18 | 46 | 28 | да |
| Sialidase | P29767.1 | 7e-15 | 53 | 26 | да |
| Sialidase-1 | P25257.1 | 5e-14 | 48 | 26 | да |
| Sialidase | P0C6E9.1 | 8e-11 | 17 | 33 | да |
| Sialidase-3 | Q9JMH7.1 | 3e-04 | 17 | 23 | да |
| Sialidase | P15698.1 | 0.002 | 32 | 26 | да |
| Phosphoglycerate kinase | P08966.1 | 7.5 | 4 | 42 | нет |
| Phosphoglycerate kinase | P08967.1 | 9.4 | 4 | 42 | нет |
Выравнивание можно скачать здесь
Домены на изображении выделены красной полоской над последовательностями. Вероятней всего,
первые 8 белков образуют общую семью. Несмотря на высокой показатель E-value восьмого белка,
его доменная структура свидетельствуют о его родстве с прочими нейроамидазами. Другие два белка,
значение E-value которых было больше единицы, имеют отличающуюся функцию не входят в одни и те
же блоки с нейроамидазами
Задание 2
Два белка семейства HTH_3 я выравнил с помошью Blast. Последовательности принадлежали бактериям
Desulfotomaculum kuznetsovii (F6CLM1_DESK7) и Micoplasma sp. (R7NFH3_9MOLU).
Судя по карте выравнивания ген Micoplasma (по оси абсцисс) представляет из себя 2 повторяющихся
домена, а ген Desulfotomaculum kuznetsovii - целых три копии того же домена.
Видимо, домен PF01381 хорошо дуплицируется,поэтому переход от удвоенного состояния
к утроенному нельзя назвать редким.
Карта локального сходства построена при E-value = 1.0e-5 и длине слова 2
