1) На поверхности белка присутствуют небольшие гидрофобные участки, однако очевидных мест связывания молекулы с лигандом

найти не получилось.

2)Даже на расстоянии 7 ангстрем атомы не закрывают остаток, что говорит о неплотной укладке атомов в гидрофобном ядре.

Среднее расстояние атомов, не имеющих ковалентную связь- 5 ангстрем. Радиус Ван-дер-Ваальса для кислорода- 1.4 ангстрема.

Вода легко может проникнуть в гидрофобное ядро.

3)Белок взаимодествует с остовом ДНК своими заряженными участками. Связь белка с ДНК требуется для Полимераз, факторов транскрипции

и иных сопряжённых с экспрессией белков.