Задание 1
Характеристики выравнивания трёх геномов
Achromobacter xylosoxidans
Выравнивания
покрытие геномов гомологичными участками
сходство на гомологичных участках геномов
LN831029.1 vs CP012046.1
75%
91%
LN831029.1 vs CP014028.1
87%
99%
Рис. 1 Глобальное выравнивание геномов
Achromobacter xylosoxidans
LN831029.1 vs CP012046.1
Рис. 2 Глобальное выравнивание геномов
Achromobacter xylosoxidans
LN831029.1 vs CP014028.1 Как видно из первого графика гомологичности, в геноме CP012046.1 произошло 2 инверсии (отмечены красной рамочкой) Участок CP014028.1 (рис. 2) отличается от LN831029.1 разным порядком двух 3.5-миллионных участков. Когда-то произошла глобальная транслокация
© Максим Григорьян, 2016