Задание 1

Характеристики выравнивания трёх геномов Achromobacter xylosoxidans

Выравниванияпокрытие геномов гомологичными участкамисходство на гомологичных участках геномов
LN831029.1 vs CP012046.1 75%91%
LN831029.1 vs CP014028.1 87%99%



Рис. 1 Глобальное выравнивание геномов Achromobacter xylosoxidans LN831029.1 vs CP012046.1


Рис. 2 Глобальное выравнивание геномов Achromobacter xylosoxidans LN831029.1 vs CP014028.1

Как видно из первого графика гомологичности, в геноме CP012046.1 произошло 2 инверсии (отмечены красной рамочкой)
Участок CP014028.1 (рис. 2) отличается от LN831029.1 разным порядком двух 3.5-миллионных участков. Когда-то произошла глобальная транслокация


© Максим Григорьян, 2016