| Толщина гидрофобной части белка в мембране | 31.8 ± 1.4 A |
| Координаты трансмембранных спиралей | A - Tilt: 11° - Segments: 1( 7- 29), 2( 39- 60), 3( 78- 96),
4( 106- 125), 5( 135- 157), 6( 177- 199), 7( 205- 219) |
| Среднее количество остатков в трансмембранном тяже белка | 45 |
| В какой мембране находится белок | Внешняя мембрана архей |
Также был выбран рецептор Койлицина I (2hdf), трансмембранную часть которого образует бета-бочка.
| Толщина гидрофобной части белка в мембране | 23.4 ± 0.9 A |
| Координаты трансмембранных спиралей | A - Tilt: 4° - Segments: 1(164-173), 2(184-192), 3(199-208), 4(235-243), 5(250-258), 6(275-283), 7(288-296), 8(315-323), 9(330-338), 10(362-371), 11(376-384), 12(395-403), 13(408-415), 14(455-463), 15(471-477), 16(531-538), 17(543-550), 18(573-579), 19(587-593), 20(615-624), 21(627-634), 22(655-662) |
| Среднее количество остатков в трансмембранном тяже белка | 12 |
| В какой мембране находится белок | Внешняя мембрана Грам-отрицательных бактерий |
С помощью двух сервисов были предсказаны положения альфа-спиралей Бактериородопсина I (4pxk) в трансмембранном пространстве при помощи сервисов TMHMM и
Phobius. Далее на рисунках представлены результаты их работы. Как видно из графмков, обе программы предсказали пять трансмембранных участка. На изображении
бактериородопсина также можно насчитать 5 трансмембранных сегментов, что указывает на верность предсказаний.
Результат выдачи Phobius
Результат выдачи TMHMM