Практикум 4: взаимодействия в белке BtSCoV-Rf1.2004 PLpro

pdb_id: 7SKR

Водородная связь, затрагивающая атомы остова белка

Рис. 1
Рис. 1. Водородные связи, поддерживающие бета-листы (остальная структура скрыта)

Водородная связь, затрагивающая атомы боковых радикалов аминокислот

Рис. 2
Рис. 2. Водородная связь между карбоксилом глутамата и амидной группой глутамина

Солевой мостик

Рис. 3
Рис. 3. Солевой мостик между лизином и глутаматом

Дисульфидная связь

В исследуемом белке несмотря на наличие в структуре семи цистеинов, дисульфидные связи отсутствуют.

Рис. 4
Рис. 4. Остатки цистеина в структуре белка

Стекинг

Рис. 5
Рис. 5. Параллельно сдвинутый пи-пи стекинг фенилаланина и тирозина