Некоторые особенности в аминокислотной последовательности белка TENI_BACSU
Последовательность состоит из 205 аминокислотных остатков:
MELHAITDDS KPVEELARII ITIQNEVDFI HIRERSKSAA DILKLLDLIF EGGIDKRKLV
MNGRVDIALF STIHRVQLPS GSFSPKQIRA RFPHLHIGRS VHSLEEAVQA EKEDADYVLF
GHVFETDCKK GLEGRGVSLL SDIKQRISIP VIAIGGMTPD RLRDVKQAGA DGIAVMSGIF
SSAEPLEAAR RYSRKLKEMR YEKAL
1. С 70 остатка до 72 остатка наблюдается поворот (состоит из трех аминокислотных остатка) в последовательности:
ID TENI_BACSU_10; parent: TENI_BACSU
FT TURN 70 72
SQ Sequence 3 AA;
FST
//
2. Белок состоит из 9 ?-листов и 12 ?-спиралей, которые включают в себя 139 аминокислотных остатков.
3. Еще 66 аминокислотных остатков белка не входят в состав ?-листов и ?-спиралей
Записи банка трехмерных структур PDB
• PDB:3QH2
• PDB:1YAD
Было найдено только две записи.
Таблица встречаемости в SwissProt белков из Firmicutes, имеющих функцию, сходную с функцией белка TENI_BACSU из Bacillus subtilis
| Формулировка функции белка | Строка запроса | Количество найденных документов |
| Regulatory protein of the sporulation (только для полноразмерных последовательностей | ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & (([swissprot-Description:regulatory*] & [swissprot-Description:sporulation*]) ! [swissprot-Description:fragment*])) |
4 |
| Regulatory protein TenI (только для полноразмерных последовательностей) | ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & ((([swissprot-Description:regulatory*] & [swissprot-Description:protein*]) & [swissprot-Description:TenI*]) ! [swissprot-Description:fragment*])) |
1 |
| Regulatory protein of the sporulation | ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & (([swissprot-Description:regulatory*] & [swissprot-Description:protein*]) & [swissprot-Description:sporulation*])) |
4 |
| Наличие TenI | ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & [swissprot-Description:TenA*]) |
1 |
TENI_BACSU не является необходимым для организма белком, но затрагивает частоту споруляции и влияет на образование некоторых внеклеточных ферментов.
Последовательности гомологичных белков
Поиск гомологов производился на основе первого запроса. Найденные последовательности представлены в fasta-формате в этом файле.