PubMed - текстовая база данных публикаций на английском языке, на основе раздела «биотехнология» Национальной медицинской библиотеки США (NLM). Эта база данных была разработана Национальным центром биотехнологической информации (NCBI) и является бесплатной версией базы данных MEDLINE. PubMed документирует медицинские и биологические статьи из специальной литературы, а также даёт ссылки на полнотекстовые статьи. Документировано около 3800 биомедицинских изданий. Ежегодно база данных PubMed увеличивается на 500 000 документов (по материалам Википедии: http://ru.wikipedia.org/wiki/PubMed).
Именно эта база данных была использована для поиска информации о классе белков Ink4,которые принимают участие в процессах внутриклеточной регуляции.
PubMed позволяет производить поиск различной степени сложности. Простейшим является поиск по ключевым словам, т.е. терминам, выражающим основное смысловое содержание информационного запроса.
Поиск информации о функции исследуемого белка был осуществлен запросами, представленными в таблице 1.
Таблица 1. История запросов в PubMed и их результаты
| Запрос | Запрос, как его понял PubMed | Всего находок | Всего в открытом доступе | Всего обзоров |
| Ink4 and regulatory | Ink4[All Fields] AND regulatory[All Fields] | 49 | 16 | всего 11 в свободном доступе 1 |
| J Biol Chem[ta] OR Nature[TA] and Ink4 and regulatory | "J Biol Chem"[Journal] OR "Nature"[Journal] AND (Ink4[All Fields] AND regulatory[All Fields]) | 2 | 1 | 0 |
| Serrano[au] AND cell cycle[All Fields] AND Ink4[ti] AND regulatory[All Fields] | Serrano[au] AND ("cell cycle"[MeSH Terms] OR ("cell"[All Fields] AND "cycle"[All Fields]) OR "cell cycle"[All Fields]) AND Ink4[ti] AND regulatory[All Fields] | 2 | 1 | 0 |
| 2000[DP] or 2001[DP] or 2002[DP] and Ink4 and regulatory | 2000[DP] OR 2001[DP] OR 2002[DP] AND (Ink4[All Fields] AND regulatory[All Fields]) AND "humans"[MeSH Terms] | 10 | 2 | 3 |
| Ink4[ti] AND regulatory[All Fields] and inhibitor | Ink4[ti] AND regulatory[All Fields] AND inhibitor[All Fields] | 11 | 3 | 3 |
После анализа результатов, представленных в соответствующих столбцах таблицы, был выбран наиболее оптимальный запрос, который находит несколько наиболее подходящих статей с открытым доступом:
Ink4[ti] AND regulatory[All Fields] AND
inhibitor[All Fields] AND "loattrfree full text"[sb]
Поиск в PubMed направлен на обзор всех статей, содержащих ключевые слова поиска. Однако, не все статьи описывают именно исследуемый белок - некоторые содержат лишь упоминание о нем. Поэтому удобно создавать персональную коллекцию публикаций, в которой будут те статьи, которые наиболее оптимальны и содержательны с точки зрения пользователя.
Статьи, содержащие описание функции класса белков Ink4 можно посмотреть, пройдя по этой ссылке.
Новый механизм инактивации локуса Ink4\ARF