Информация о ферменте:
- Идентификатор в UniProt: Q16696
- ЕС-код: EC 1.14.14.1 (показана одна ферментативная активность)
Расшифровка ЕС-кода
Классификация фермента: ЕС
Класс: 1 – Oxidoreductases (оксиредуктазы)
Подкласс: 1.14 - Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (воздействие на парные доноры с окислением или восстановлением молекулы кислорода)
Подподкласс: 1.14.14 – With reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen (с восстановлением флавина или флавопротеина как одного из доноров и окислением одного атома кислорода)
Порядковый номер:1.14.14.1 - Unspecific monooxygenase (неспецифичная монооксигеназа)
Схема катализируемой реакции:
AH + B = A + BH
RH + reduced flavoprotein + O2 = ROH + oxidized flavoprotein + H2O
Ферменты человека со схожими функциями
С помощью SRS было определено количество белков человека со схожей функцией:
1.* - 4036
1.14.* - 244
1.14.14.* - 45
1.14.14.1 – 42
Сохранение функций белков со схожей последовательностью
С помощью UniProt был получен список всех белков мыши (Mus musculus) из Swiss-Prot, у которых класс (т.е., первое число) классификации EC совпадает с таковым рассматриваемого фермента (Последовательности, Таблица ID и EC-кодов).
Количественные результаты поиска:
1.* - 710
1.14.* - 183
1.14.14.* - 38
1.14.14.1 – 36
С помощью программы blastp был проведен поиск гомологов:
seqret sw:2A13_HUMAN
makeblastdb -in list.fasta -out db -dbtype prot blastp
-query est1a_human.fasta -db db -out blast.out -evalue 1
Всего нашлось 30 белков (порог e-value 10), 11 из которых можно считать достоверными гомологами (e-value меньше 0,001).
Классификация ЕС сохраняется у нескольких первых находок (Q91X75_MOUSE, CP2A5_MOUSE, CP2A4_MOUSE).
Для белков с e-value от 5e-11 в классификации ЕС совпадает только класс.