Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)
Информация о ферменте:
- Название: Cytochrome P450 2A13 (цитохром Р450)
- Идентификатор в UniProt: Q16696
- Код белка в KEGG: hsa:1553
Метаболические пути фермента
С помощью сервера KEGG нашли 2 метаболических пути, ассоциированных с изучаемым белком (Таблица 1).
Метаболические пути белка Cytochrome P450
| Идентификатор в KEGG | Название на английском языке | Название на русском языке |
| hsa00980 | Metabolism of xenobiotics by cytochrome P450 (карта) | Метаболизм ксенобиотиков цитохромом Р450 |
| hsa05204 | Chemical carcinogenesis | Химический канцерогенез |
Поиск в KEGG структурных формул
Для работы были выбраны:
- L-триптофан (аминокислота)
- Мелатонин (гормон)
С помощью KEGG LIGAND (ссылка: http://www.genome.jp/kegg/ligand.html) были найденны структуры указанных веществ (Таблица 2).
Найденные структурные формулы
| Название на русском языке | Название на английском языке | Идентификатор | Структурная формула |
| L-триптофан | L-Tryptophan | C00078 |  |
| Мелатонин | Melatonin | C01598 |  |
Метаболический путь заданных соединений
С помощью KEGG PATHWAY был определен метаболический путь, которым соеденены L-триптофан и мелатонин (Рис. 2).
Карта: ko00380 Метаболизм триптофана (Tryptophan metabolism)
Путь:
L-триптофан -> 5-гидрокситриптофан -> Серотонин -> N-ацетилсеротонин -> Мелатонин
L-триптофан
5-гидрокситриптофан
Серотонин
N-ацетилсеротонин
Мелатонин
Рис. 1 Схема метаболического пути от L-триптофан до мелатонина и структурные формулы участвующих в нем соединений
Все реакции рассматриваемого метаболического пути идут только в одном направлении (Рис.2)
На рисунке отмечены:
- Красный - L-триптофан
- Зеленым – мелатонин
- Желтым – промежуточные соединения