Файл структурных факторов «Structure factors» для белка 3QH2 имеется в текстовом формате (CIF) в PDB.

В файле содержится полезная информация, которая разделена группы (каждая группа отделена от следующей значком #).

Первая группа данных отображает информацию об авторах, датах внесения и изменения информации (_audit.). Следующая группа данных описывает элементарную ячейку (_cell.). Далее идет информация о деталях дифракционного эксперимента. Также присутствует ID записи (_entry.id), группа, описывающая детали эксперимента (_exptl.), группа с информация об измерении рефлексов (_reflns.). Потом следует информация о симметриях.

Потом начинаются со строки «loop_» данные об измеренных структурных факторах. Сначала построчно перечислены названия колонок (элементы категории _refln), а потом в строках записаны параметры структурных факторов.

• Общая информация:

  _refln.crystal_id (указывает на _exptl_crystal.id, в которой есть идентификатор только одного список с информацией об использованном кристалле)

  _refln.wavelength_id (указывает на _diffrn_radiation_wavelength.id, в которой есть идентификатор только одной группы данных)

  _refln.scale_group_code (указывает на _reflns_scale.group_code, в которой есть информация о величинах структурных факторов)

• Колонки с целыми числами h, k, l:

  _refln.index_h

  _refln.index_k

  _refln.index_l

• Использован ли структурный фактор для оптимизации модели:

  _refln.status

• F-среднее значение измерения структурного фактора:

  _refln.F_meas_au

• F_sigma – среднее квадратичное отклонение от среднего:

  _refln.F_meas_sigma_au

Одна строка соответствует одному структурному фактору. Таблица структурных факторов.

В строке _diffrn_reflns.number указано, сколько всего структурных факторов (55590 в нашем случае). Структурные факторы, которые были использованы для оптимизации модели, обозначены «о» в _refln.status (в нашем случае 52458).

По определению, представленном в задании, неизмеренными структурными факторами считаем факторы, которые соответствуют явно пропущенным тройкам чисел (h, k, l). Явно пропущенные - это такие, что (1) их нет в файле; (2) хотя бы одна тройка (h', k', l') с h'>=h, k'>=k, l'>=l присутствует в файле.

Таблица 2