|
Консервативностьболее 80% идентичности более 60% идентичности более 40% идентичности менее 40% идентичности выделено белым
| |
блока IPB000086 из базы данных BLOCKS
| Данные были получены следующим образом:![]() ![]() ![]() ![]() |
Вычисление весов аминокислотных замен на основе множественных выравниваний
200 блоков из базы данных BLOCKS
| |
|
Данная таблица позволяет нам сравнить вес замен посчитанный в трех случаях. Оценив первую строку таблицы можно заметить, что наибольший вес замена- аргинина, аргинин имеет в блоке IPB000086, в общем по сравнению с данными всей таблицы естественно, что эта замена остатка самого на себя более благоприятна. Второй пример замены аргинина на лизин менее благоприятен и самой не благоприятной является замена аргинина на тирозин, что является вполне обоснованным их строением. Еще можно заметить, что данные в столбце "200 блоков" и BLOSUM62 более схожи между собой нежели данные из IPB000086 с этими двумя столбцами т.е. вероятность схожести данных по всем белкам и двухстам произвольным выше, нежели по одному единственному с ними обоими. |