Глобальное и локальное выравнивание


На страницу 2-го семестра
  1. Поиск белка по его последовательности (см. "task7.html", myprot.fasta)
    Выполнено на сервере NCBI (
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)
  2. Поиск белка по его гомологу (см. "task7.html", secondprot.fasta)
    Гомолог из Yersinia pestis присутствует в Swiss-Prot и поэтому идёт в списке первым. DKGA_ECOLI также присутствует (второй в списке). score=399;
    E-value=6e-111;
    начало и конец выравнивания во входной последовательности - 1-274;
    начало и конец выравнивания во находке - 1-274;
    Identity = 73%.
  3. Поиск белка по фрагментам его последовательности (см. "task7.html", thirdprot.fasta)
    BLASTP вообще не смог найти ни одного гомолога, это связано с тем, что недостаточно сходства. Искать в других банках бесполезно, так как DKGA_ECOLI был самым вероятным гомологом.

© Моросанова Мария