Банк EMBL

Задание 1. Сравнение разных записей в EMBL
Идентификатор записи EMBL Тип молекулы
Класс данных
Раздел EMBL
 Дата создания
документа
Описание
Длина последовательности
U00096 геномная ДНК (genomic DNA) STD PRO(прокариоты) 23 февраля 2006 Полный геном Escherichia coli K12 MG1655 4639675
U28377 геномная ДНК (genomic DNA) STD PRO(прокариоты) 5 июля 1995 Часть генома Escherichia coli K12 MG1655 примерно с 65 по 68 минуты 141744
Эти 2 записи различаются тем, что первая содержит полный геном, а вторая лишь участок. Также различаются и даты создания этих документов, т.к. для секвенирования всего генома требуетсяс гораздо больше времени, чем на его отдельную часть. А в остальном эти записи совпадают.

Задание 2. Сравнение описаний гена Escherichia coli в двух разных записях EMBL
  I II
ID записи U28377 U00096
Начало гена в записи 111126 3154645
Конец гена в записи 111836 3155472
Направление гена Прямое Прямое
Примечания Короче гена из полного генома на 117 нуклеотидов. Не хватает начального участка  

Процент идентичности этих 2-х последовательностей 85.9%, но это не значит , что они сильно различаются. Длина последовательности из полного генома больше на 117 нуклеотидов в начале. Так что у другой последовательнеости в начале 117 гэпов, а в остальном они полностью совпадают.
Задание 3. Знакомство с записью гена из эукариотического генома
Структура транслируемых участков гена DDAH:
--[214868..215164]--..--[216676..216792]-->
В этом гене 6 экзонов. Самый короткий экзон имеет длину в 74 нуклеотида, самый длинный - 297. Самый длинный интрон имеет длину в 481 нуклеотид, самый короткий - 120.
На страницу 3-го семестра
© Моросанова Мария