KEGG

Метаболические пути. KEGG

Заданный фрагмент метаболического пути - синтез глутатиона из аминокислот. С помощью карты KEGG "Метаболизм глутатиона" я определила, что это вещество синтезируется из цистеина, глутамата и глицина.

С помощью следующих команд программе(см.файл), которая раскрашивает объекты на метаболических картах, было получено изображение карты с выделенным цветом искомым путем синтеза глутатиона. Вот этот путь:

Выбранный путь синтеза глутатиона состоит из двух этапов: на первом цистеин и глутамат связываются вместе за счет работы глутамат-цистеиновой лигазы, а на втором к полученному веществу присоединяется глицин за счет работы глутатион-синтетазы. Мне кажется, что такую последовательность можно назвать цепью реакций. Первый этап синтеза интересен тем, что глутамат образует пептидную связь с цистеином не как обычно, а углеродом карбоксильной группы боковой цепи.
Возможный путь синтеза глутатиона из аминокислот(цистеина, глутамата, глицина)

Этап	Ферментативная реакция	Фермент
1	ATP + L-glutamate + L-cysteine = ADP + phosphate + gamma-L-glutamyl-L-cysteine	EC 6.3.2.2
2	ATP + gamma-L-glutamyl-L-cysteine + glycine = ADP + phosphate + glutathione	EC 6.3.2.3

Данная цепочка реакций у конкретных организмов

Организм	Возможен ли синтез глутатиона по данным KEGG ? (Да/нет)	Краткое обоснование
Homo sapiens	да	оба фермента у человека есть и аминокислоты, естественно, тоже
Escherichia coli	да	известны оба фермента
Pseudomonas aeruginosa PAO1	да	известны оба фермента
Methanococcus janaschii	нет	для него не существует эта карта, что значит, что у этого организма в принципе не происходят реакции, описанные на этой карте

На страницу 4-го семестра