учебная страничка маши смирновой

анализ интерферонов I типа

общая характеристика

интерфероны i типа (альфа, бета) относятся к большому суперсемейству спиральных цитокинов, которое включает гормоны роста, интерлейкины, несколько колониестимулирующих факторов и другие регуляторные молекулы.

доменные архитектуры

в статье с исследованием гена рецептора альфа/бета интерферона (IFNAR), получили, что внеклеточная часть этого гена состоит из двух доменов D-2000, каждый из них, в свою очередь, делится на SD100-домены, которые имеют структурное сходство с доменами иммуноглобулин, что говорит об их общем эволюционном происхождении.

3d-структуры

структура Human-interferon beta состоит их двух доменов. обладает противовирусными и антипролиферативными свойствами.

структура Ovine-inerferon tau состоит из одного домена. это гормон, секретирующийся у овец во время ранней беременности.

структура THREE-DIMENSIONAL CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT MURINE INTERFERON-BETA имеет новую топологию α-спирального пучка, состоящего из 5 α-спиралей.

таксономическая распространенность невысокая, интерфероны первого типа распространены только среди эукариот.

таблица 1

карты локального сходства

для построения карты локального сходства были выбраны белки A0AAE0V1I5 и A0AAN8LKJ0. рис. 3 показывает, что на участках ~347-451 белка A0AAN8LKJ0 и ~210-290 белка A0AAE0V1I5 последовательности совпадают. на небольших участках ~388-389, ~403-405 белка A0AAN8LKJ0 наблюдается прерывистость. это может быть связано со схемами архитектуры белков (рис. 1 и рис. 2). участок Interferon у белка A0AAE0V1I5 чуть короче, чем у A0AAN8LKJ0.

рис. 1. схема доменной архитектуры белка A0AAE0V1I5

рис. 2. схема доменной архитектуры белка A0AAN8LKJ0

рис. 3. карта локального сходства

таблица 2