Общая характеристика
Интерфероны I типа (альфа, бета) относятся к большому суперсемейству спиральных цитокинов, которое включает гормоны роста, интерлейкины, несколько колониестимулирующих факторов и другие регуляторные молекулы.
Доменные архитектуры
В статье https://doi.org/10.1016/S0021-9258(18)45950-9 с исследованием гена рецептора альфа/бета интерферона (IFNAR), получили, что внеклеточная часть этого гена состоит из двух доменов D-2000, каждый из них, в свою очередь, делится на SD100-домены, которые имеют структурное сходство с доменами иммуноглобулин, что говорит об их общем эволюционном происхождении.
3D-структуры
Структура Human-interferon beta состоит их двух доменов. Обладает противовирусными и антипролиферативными свойствами.
Структура ovine-inerferon tau состоит из одного домена. Это гормон, скеретирующийся у овец во время ранней беременности.
Структура THREE-DIMENSIONAL CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT MURINE INTERFERON-BETA имеет новую топологию α-спирального пучка, состоящего из 5 α-спиралей.
Таксономическая распространенность невысокая, интерфероны первого типа распространены только среди эукариот.
Таблица 1
Параметр | Значение |
---|---|
AC pfam | AC: PF00143 |
ID pfam | Interferon |
#SEED | 96 |
#All | 2077 |
#SW | 82 |
#architectures | 12 |
#3D | 25 |
Taxonomy #eukaryota | 5783 |
Taxonomy #archaea | - |
Taxonomy #bacteria | - |
Карты локального сходства
Для построения карты локального сходства были выбраны белки A0AAE0V1I5 и A0AAN8LKJ0. Рис. 3 показывает, что на участках ~347-451 белка A0AAN8LKJ0 и ~210-290 белка A0AAE0V1I5 последовательности совпадают. На небольших участках ~388-389, ~403-405 белка A0AAN8LKJ0 наблюдается прерывистость. Это может быть связано со схемами архитектуры белков (рис. 1 и рис. 2). Участок Interferon у белка A0AAE0V1I5 чуть короче, чем у A0AAN8LKJ0.



Таблица 2
Параметр | Значение |
---|---|
доменная архитектура 1 | PF01498-PF13358-PF00143 |
Белок с архитектурой 1 | A0AAN8LKJ0 |
доменная архитектура 2 | PF00069-PF00143 |
Белок с архитектурой 2 | A0AAE0V1I5 |