Cysteine desulfurase IscS 2 (029689)

Структура в целом

Тип макромолекул: Цистеин десульфураза IscS 2
Полимерная цепь в структуре 1: цепочка А
Биологическая единица: димер (1 единица)

Общий вид структуры, биологическая единица — 1. Общий вид структуры. Цвета соответствуют одному димеру. В каждом димере присутствует 1 белковая цепь (Chain A).

Ассиметрическая единица — 1. Вид ассиметрической единицы. В одну ассиметрическую единицу входит 1 белковая цепь.

Анализ отдельных цепей

Вторичная структура — 2. Распределение вторичной структуры. Розовый: α-спирали, Голубой: β-тяжи. Преобладают α-спирали.

Количество полипептидных цепей: 1
Организм: Archaeoglobus fulgidus DSM 4304
UniProt ID: 029689
Функция: катализирует удаление элементарной серы из цистеина для производства аланина
Мутации: присутствуют
Модифицированные остатки: отсутствуют

Анализ малых молекул

Файл со строками, соответствующими малым молекулам в PDB файле: small_molecules

4'-ДЕОКСИ-4'-АМИНОПИРИДОКСАЛ-5'-ФОСФАТ

Краткое название: PMP

Полное название: 4'-DEOXY-4'-AMINOPYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE

Структура PMP — Присутствие в активном центре: Нет

ТЕТРАЭТИЛЕНГЛИКОЛЬ

Краткое название: PG4

Полное название: TETRAETHYLENE GLYCOL

Структура PG4 — Присутствие в активном центре: Да
Подробная информация в файле: molecules

АЦЕТАТ ИОН

Краткое название: ACT

Полное название: ACETATE ION

Структура ACT — Присутствие в активном центре: Нет

ИОН КАЛЬЦИЯ

Краткое название: CA

Полное название: CALCIUM ION

Структура CA — Присутствие в активном центре: Да
Подробная информация в файле: molecules

ИОН ХЛОРИДА

Краткое название: CL

Полное название: CHLORIDE ION

Структура CL — Присутствие в активном центре: Нет

Окружение иона кальция — 3. Окружение иона Ca²⁺ (5 Å).

Контакты в структуре

Водородные связи остова — 1. Водородные связи между атомами остова белка. Показаны расстояния между донорами и акцепторами главной цепи белка.

Водородные связи радикалов — 2. Водородные связи с участием боковых цепей аминокислот.

Солевой мостик — 3. Солевые мостики между GLU-97 и HIS-98 и другими остатками.

Цистеины белка — 4. Все цистеиновые остатки в структуре. Дисульфидные связи отсутствуют.

Стекинг-взаимодействия — 5. Стекинг-взаимодействия между ароматическими остатками TYR-6 и TYR-3.