Сравнительный анализ геномов вируса, бактерии, и млекопитающего
Геномы данных организмов существенно различаются как по размеру, так и по их структуре.
В Таблице 1 приведены общие сведения об этих геномах.
Таблица 1 : Информация о геномах организмов.
Информация получена из страниц базы данных геномов на сайте NCBI:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome
| Организм | Число хромосом. Гомологичные хромосомы - от папы и от мамы - считаются за одну | Число молекул ДНК в клетке. Гомологичные хромосомы считаются разными | Есть ли другие ДНК | Число генов |
| Вирус Tomato leaf curl Joydebpur virus | 1 | 1 | нет | 6 |
| Бактерия Rhodobacter sphaeroides | 2 хромосомы 5 плазмид | 7 молекул днк в клетке | нет | 4474 |
| Млекопитающее Mus musculus | 21 | 40 | есть митохондриальная ДНК | 44443 |
Обсуждение
Для существования Tomato leaf curl Joydebpur virus достаточно 6 генов, кодирующих 6 протеинов.
Такое малое число протеинов объясняется тем, что вирус использует молекулярный аппарат клетки.
Число генов бактерии на 3 порядка больше числа генов вируса. Число генов мыши на 4 порядка больше числа генов вируса.
Длина генома бактерии больше длины генома вируса в 4.6Mbp / 2.76Kbp = 1670 раз.
Длина генома Mus musculus в длинах вируса равна 2725Mbp / 2.76Kbp = 987318, то есть геном млекопитающего
почти в миллион раз больше генома вируса.
Если же вытянуть все молекулы ДНК этих организмов в одну нить, то длина генома получится равной (принимая расстояние между соседними парами нуклеотидов равным 3.4*10-10m):
- Длина генома вируса 2,761bp * 3.4*10-10m = 9.39*10-7m.
- Длина генома бактерии 4,604,453bp * 3.4*10-10m = 1.56*10-3m.
- Длина генома мышки 2,725,520,000bp * 3.4*10-10m = 0.93m.