Выравнивание и гомология
Задание 1
Задание 1
Создано 2 изображения - первое с раскраской BLOSUM62 с порогом консервативноcти 30 (task_01_1) и второе с раскраской ClustalX (task_01_2)
Задание 2
Найдены вертикальные блоки, кластеры и самый длинный участок, не входящий в состав блоков и кластеров (task_02_1).
Выделенные в группу "homological sequences" остатки GNDLP в последовательностях BUTPB/1-151 и CELLD/1-149 могут считаться гомологичными поскольку наблюдается высокое сходство этих последовательностей между собой при отсутствии сходства с другими последовательностями (task_02_2)
Гомологичные остатки
Задание 3
Был выбран блок длиной 19 с координатами 0-19. Число абсолютно консервативных позиций - 10, процент - 52.63%. Число абсолютно функционально консервативных позиций - 15, процент - 78.94%. Число консервативных на 70 % позиций - 14, процент - 73.78%. Число функционально консервативных на 70 % позиций - 17, процент - 89.47%. Для самого длинного участка выравнивания, не входящего в состав блоков и кластеров, которым явлется участок с координатами 20-29, число гэпов 19, процент - 31.66%.
Задание 4
Добавлена в выравнивание последовательность и вписана вручную в исходное выравнивание (task_04)
Задание 5
Удалось найти 18 совпадений с консервативными позициями в основном выравнивании, что соответствует 11.46% (task_05)
Задание 6
Блоков и кластеров не было найдено (task_06_1,task_06_2)