Отчет
Теорминимум
Нуклеиновые кислоты — высокомолекулярные линейные полярные биополимеры, образованные остатками нуклеотидов. Нуклеозиды - соединения, содержащие азотистистое основание, связанное с сахаром. Нуклеотиды - фосфорные эфиры нуклеотидов. Примеры нуклеозидов и нуклеотидов приведены на рисунке 1. Сахар в нуклеозидах соединен с азотистым основанием гликозидной связью. Как правило, это N-гликозидная связь - между аминогруппой (или другой группой, содержащей атом азота) с сахаром.
Упражнение 1
Рис. 1. Примеры нуклеотидов ДНК - 2'-дезоксигуанозиндифосфат и 2'-дезокситимидинмонофосфат с двумя и одним остатком фосфорной кислоты соответственно. Примеры нуклеозидов РНК - уридин и псевдоуридин.
Атомы, обазующие гликозидную связь - красным.
Упражнение 2
ДНК и РНК – линейные сополимеры ортофосфорной кислоты и сахара (дезоксирибозы или рибозы соответственно). На рисунке 2 представлена структура фрагмента двуцепочечной ДНК.
Рис. 2. Фрагмент двуцепочечной ДНК. Между азотистыми основаниями показаны канонические взаимодействия.
Задание 3
Данный раздел посвящен сопоставлению структуры водородных связей в канонических и теоретически возможных неканонических парах, образованных цитозином и гуанином. На рисунке 3 показаны 3 пары (одна каноническая и две неканонических), которые были получены, используя ChemSketch. Были взяты только пары G-C с как минимум двумя водородными связями между разноименными основаниями; различные возможные таутомеры учтены не были. Для второй картинки молекулу цитозина просто "перевернули" относительно гуанина, и выделили образовавшиеся 2 связи. Для третьей каритнки провели рассуждение: NH2 группа цитозина может связаться с O или c одним из двух атомов N гуанина. Пусть NH2 группа связался с N атомом гуанина, вторая связь образовалась тоже между N атомом и NH2 группой.
Рис. 3 Возможные пары G-C.