Краткое описание генома вируса Aedes pseudoscutellaris reovirus

Член семейства Реовирусы с девяти сегментированным геномом.[1]
Этот вирус был извлечен из клеток комара Aedes pseudoscutellaris и назван Aedes pseudoscutellaris reovirus.
Абривиатура - APRV. Вирионы однобортные, имеющие скорлупу с башенками.Однако они не являются непроницаемыми, в отличие от Cypovirus.
APRV размножается в различных линиях комариных клеток, но не размножаются в клетках мышей и млекопитающих.
Полный анализ последовательности, показал что APRV филогенетически относится к cyprovirus, fijiviruses и oryzaviruses.
Максимальная идентичность аминокислот с cypoviruses, oryzaviruses или fijiviruses в полимеразе совместима со значениеми, наблюдаемым между этими родами и более низкими таксонами в пределах данного рода.Это говорит о том, что APRV следует классифицировать в рамках нового рода, названного Dinovernavirus (D: двухцепочечный, I: насекомое, nove: девять от латинского "Novem", RNA: РНК-вирус) в семействе Reoviridae. [2]

Параметр	Значение
Английское название вируса	Aedes pseudoscutellaris reovirus
Русское название вируса	Реовирус ложных пластин с башенками
Количество фрагментов в полном геноме	9
Общая длина генома (п.н.)	3817
Количество кодируемых в геноме полипептидов	9
Количество "зрелых" вирусных белков	9

Аминокислотная последовательность кратчайшего полипептида вируса:

>YP_443943.1 VP9 
MNSQKVQALTTVSKLSPIDKVVKGRNIPFSMPGDRVIMLKISSLFKFGREDKESDSKFDLV
PTDCGICMVKTQLNQDEQKRTTFNDGKVIEIITYEQMKDILPMIKQAIHEFYSWRRGLMDT
STLEARNEWKPVSQLDFRRCNSNLIFYISILILSEYIIEIPIEYLTVSYGGYNFNNIRTGE
WFNTDDFNNYQKVIKSGDVCDLFLINDTGEYKYINAITHVTKTNMIFSFNMQVSRPPQLNT
TMKVRQTLSENKKQKSSSTSPETDSDMSEFFG

Главная страница.

Информация обо мне.

Сайту факультета биоинженерии и биоинформатики.

Страница первого курса.

[1] http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682205005180

[2] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16171838