Идентефикатор CDS(согласно банкам GenBank/EMBL/DDBJ): AKC28878.1
Номер доступа в Uniprot: A6GZI2
Воспользовавшись сервисом "Retrieve/ID mapping" на сайте Uniprot, по CDS мы нашли соответствующую запись Uniprot.
Данный белок имеет статус Reviewed(рецензированный), что означает, что он достаточно хорошо изучен.Был выведен из гомологии.
В иююле 2007 года была записана первая версия последовательности, а последние изменения были внесены в феврале 2017 года.
Известна полная последовательность генома патогена рыб - Flavobacterium psychrophilum.
Из поля СC(general annotation) можно узнать также много информации о нашем белке:
- Функция: участвует в глюконеогенезе, стереоспецифически катализирует превращение дигидроксиацетонфосфата (DHAP) в D-глицеральдегид-3-фосфат (G3P)
- Внутриклеточное расположение: цитоплазма.
- Является гомодимером, то есть образуется двумя одинаковыми молекулами (процесс гомодимеризации).
Таблица №1: Описание белка.
| Название атрибута |
Значение |
| UniprotID |
TPIS_FLAPJ |
| DE(рекомендуемое название) |
Full=Triosephosphate isomerase
Short=TIM
Short=TPI |
| DR(идентификатор RefSeq и PDB) |
RefSeq; WP_011963550.1; NC_009613.3.
RefSeq; YP_001296314.1; NC_009613.3.
PDB отсутствует. |
| SQ(длина в аминокислотных остатках) |
250 AA |
| SQ(молекулярная масса) |
27638 MW |
Таблица №2: Описание кластеров.
| Кластер |
Идентификатор кластера |
Дата публикации |
Количество белков |
| Uniref50 - Triosephosphate isomerase (50%) |
UniRef50_Q8A0U2 (built on seed sequence A0A149NQD2) |
February 15, 2017 |
854 |
| Uniref90 - Triosephosphate isomerase (90%) |
UniRef90_A6GZI2 (built on seed sequence A6GZI2) |
January 18, 2017 |
2 (A6GZI2 Q45FN3) |
| Uniref100 - Triosephosphate isomerase (100%) |
UniRef100_A6GZI2 (built on seed sequence A6GZI2) |
April 29, 2015 |
2 (A6GZI2 Q45FN3) |
1. Поиск по рекомендованному названию белка:
- полное название(Triosephosphate isomerase): количество всех найденных белков - 20312, количество рецензированных - 659;
- краткое название(TIM): количество всех найденных белков - 32158, количество рецензированных - 978;
- краткое название(TPI): количество всех найденных белков - 13098, количество рецензированных - 580;
2. Поиск по рекомендованному названию белка среди белков Flavobacterium psychrophilum:
- полное название(Triosephosphate isomerase): количество всех найденных белков - 3, количество рецензированных - 1;
- краткое название(TIM): количество всех найденных белков - 3, количество рецензированных - 1;
- краткое название(TPI): количество всех найденных белков - 3, количество рецензированных - 1;
3. Поиск по рекомендованному названию белка среди белков семейства Flavobacteriaceae:
- полное название(Triosephosphate isomerase): количество всех найденных белков - 262 количество рецензированных - 2;
- краткое название(TIM): количество всех найденных белков - 369, количество рецензированных - 2;
- краткое название(TPI): количество всех найденных белков - 242, количество рецензированных - 2;
4. Поиск по рекомендованному названию белка среди белков отдела Bacteroidetes:
- полное название(Triosephosphate isomerase): количество всех найденных белков - 920 количество рецензированных - 12;
- краткое название(TIM): количество всех найденных белков - 1539, количество рецензированных - 12;
- краткое название(TPI): количество всех найденных белков - 813, количество рецензированных - 22;
5. Поиск по названию homeobox(гомеобокс) среди белков позвоночных(vertebrata) и зелёных растений(viridiplantae):
- количество всех найденных белков - 5073 количество рецензированных - 224;
- Поиск по названию homeobox(гомеобокс) среди белков грибов(fungi) и инфузорий(ciliophora):
- количество всех найденных белков - 1061, количество рецензированных - 18;
6. Поиск по названию trypsin(трипсин):
- количество всех найденных белков - 13241, количество рецензированных - 310;
- Поиск по названию trypsin(трипсин), не включая его ингибиторы (trypsin not inhibitor):
- количество всех найденных белков - 10279, количество рецензированных - 101;
Страница второго семестра.
© Гурылева Мария Вячеславовна 2016.