Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b

Систематическое положение

Domain: Bacteria
Kingdom: Actinobacteria
Phylum: Coriobacteridae
Class: Coriobacteriales
Family: Coriobacteriaceae
Species: Gordonibacter pamelaeae
Strain: Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b

Информация о бактерии

Анаэробная кокко-образная бактерия. Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b был выведен из толстой кишки пациента, страдающего от болезни Крона.

Информация из записей банка RedSeq

Идентификатор записи в базе данных RedSeq на сайте NCBI, содержащий информацию о полном геноме бактерии: NC_021021 Содержание записи: черновой геном Длина последовательности генома: 3 608 022 п. н.

Окружение гена белка в геноме бактерии

Изображение гена YP_007803476.1 и некоторых его соседей

Ближайшие гены
Ближайшими соседями гена белка Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase являются гены белков hypothetical protein (YP_007803475.1) и aspartate carbamoyltransferase (YP_007803477.1). Направление каждого из этих генов +1, т е они располагаются на прямой цепи ДНК.

Расстояние между генами
Расстояние между геном белка Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase и геном белка hypothetical protein 347 п.н.
Расстояние между геном булка Pyrimidine operon attenuation protein/uracil phosphoribosyltransferase и геном белка aspartate carbamoyltransferase 4 п.н.

Рамка считывания соседей относительно гена YP_007803476.1
Рамка считывания гена белка hypothetical protein=остаток от ((3330796-3331676)/3)=+2
Рамка считывания гена белка aspartate carbamoyltransferase=остаток от ((3331676-3332267)/3)=+0

Рассматриваемый ген YP_007803476.1 и его сосед YP_007803477.1 могут входить в один оперон, т.к. расстояние между этими генами очень малы.

Источники информации