Таблица идентификаторов белка в разных базах данных:
| База данных | Идентификатор |
| Uniprot (ID) | D6EBI6_9ACTN |
| Uniprot (AC) | D6EBI6 |
| Uniref50 | UniRef50_D6EBI6 |
| RefSeq Proteins | YP_007803476.1, WP_015540426.1 |
| PDB | - |
Описание истории изменений записи Uniprot для белка аспартатаминотрансферазы.
Дата создания первой версии: 13.07.2010
Дата создания последней (22ой) версии: 01.04.2015
Комментарии по произошедшим изменениям: 1. В 2 записях добавлена информация об особенностях частей последовательности:
2. Добавлено 18 новых ссылок на другие базы данных:
3. Для возможности поиска этого белка по функции и другим категориям были добавлены 10 строк с ключевыми словами:
4. Во многих строках были добавлены ссылки на достоверность источника информации в {}, например:
5. Добавилась информация о публикации и комментариях (12):
6. Статус белка был переведен из "Predicted" в "Inferred from homology", т.е. появилась информация об ортологах у близкородственных видов
Сравнение записи в Uniprot белка аминотрансферазы и белков-гомологов.
Белки-гомологи были выбраны из базы данных Uniref50, а последний из PDB.
Основное различие гомологичных белков состоит в длине последовательности.
Сравнение данных о гамологах можно посмотреть в таблице .
Отражение особенностей белка в записи Uniprot.
Специфические особенности белков представлены в записи Uniprot в поле Feature Table (FT). На примере белка Pyrrolysine--tRNA ligase из археи Methanosarcina barkeri (strain Fusaro / DSM 804) показано наличие нестандартной аминокислоты пирролизина (Pyl). Идентификатор записи белка в Uniprot: PYLS_METBF (AC: Q46E77).
FT CHAIN 1 419 Pyrrolysine--tRNA ligase.
СПАСИБО ЗА ПРОСМОТР
© Мария Медведева