Вирус Canna Yellow Streak Virus

Leaf streaking due to CaYSV

Систематическое положение вируса

Domain: Viruses
Order: Unassigned
Family: Potyviridae
Genus: Unssigned
Species: Potyvirus
Strain: Canna Yellow Streak Virus

По типу носителя генома данный вирус относится к ssDNA positive-strand viruses,
т. е. геном содержит одну молекулу положительной линейной ДНК

Русское название

вирус с одноцепочечным ДНК геномом положительной полярности

Информация о хозяине вируса

Вирус Canna Yellow Streak Virus, или как его ещё называют CaYSV, был найден в тропических растениях, характерных для штата Миннесоты. (К сожалению, информацию о конкретном растении, в котором первоначально был обнаружен вирус, я не нашла) CaYSV является достаточно новым вирусом: его открыли в Великобритании в 2007 году.

Особенности вируса и взаимоотношения с хозяином

Вирус CaYSV вызывает у растений искривление листьев и изменяет их окраску на полосато-жёлтую. В отличие от других Canna-вирусов, которые распространяются с помощью насекомых, перелетающих от одного заражённого растения к другому, этот разделяет корневище одного растения на кусочки, которые вращивает в другие.

Описание генома из записи банка Redseq

Идентификатор записи банка RedSeq: NC_013261.1
Содержание записи: последовательность полного генома.
Длина последовательности генома: 9502 нуклеотидов.

Описание гена в геноме вируса

Как видно из Рис. 1, в полном геноме вируса содержится всего 2 гена, закодированных на одной цепи РНК. Из Рис. 1 можно заметить, что все гены разной длины и расположены в одном (положительном) направлении.

Рис. 1. Полный геном вируса с генами. Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI.

Интересной особенностью генома данного вируса является то, что некоторые гены перекрываются. Один из примеров такого перекрытия генов представлен на Рис. 2.

Рис. 2. Перекрытие генов матричного белка (YP_003208047.1, изображен сверху) и гликопротеина (YP_006423968.1, изображен снизу). Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI

Источники информации

http://www.ictvonline.org/index.asp
https://www.rhs.org.uk/advice/profile?pid=123
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/