Название организма | Acidothermus cellulolyticus 11B | Escherichia coli K12 |
Идентификатор протеома | UP000008221 | UP000000625 |
Количество последовательностей | 2157 | 4352 |
Количество аминокислот | 729829 | 1353365 |
Аминокислотный остаток | Acidothermus cellulolyticus 11B (%) | Escherichia coli K12 (%) | Разность (%) |
A | 13.73 | 9.51 | 4.22 |
L | 10.05 | 10.68 | 0.63 |
V | 9.19 | 7.07 | 2.12 |
G | 8.77 | 7.37 | 1.4 |
R | 8.5 | 5.52 | 2.98 |
P | 6.18 | 4.43 | 1.75 |
T | 5.91 | 5.39 | 0.52 |
D | 5.78 | 5.15 | 0.63 |
E | 5.13 | 5.76 | 0.63 |
S | 5.08 | 5.8 | 0.72 |
I | 4.2 | 6.01 | 1.81 |
F | 2.93 | 3.89 | 0.97 |
Q | 2.76 | 4.44 | 1.68 |
H | 2.18 | 2.27 | 0.09 |
Y | 2.13 | 2.84 | 0.72 |
N | 1.91 | 3.94 | 2.03 |
K | 1.71 | 4.41 | 2.7 |
M | 1.62 | 2.83 | 1.2 |
W | 1.39 | 1.53 | 0.14 |
C | 0.85 | 1.16 | 0.31 |
Три наиболее часто встречающиеся аминокислоты почти совпадают в этих протеомах: аланин и лейцин на первых местах в обоих протеомах (только на разных местах), но на третьем месте у Escherichia coli K12 стоит аминокислота глицин, а не валин. Последние две по встречаемости аминокислоты тоже совпадают, а вот третья с конца у Escherichia coli K12 аминокислота гистидин, а не метионин, которая у E. coli на четвертом месте с конца. Для аминокислотного остатка аденина самая большая разница в 4.22% в пользу Acidothermus cellulolyticus 11B, а для глутамина в 2.03% в пользу Escherichia coli K12.
Командная строка для получения файла с табличкой: 'python3 pr7.py AcB11.fasta EcoliK12.fasta', вот сам скрипт на питоне и файлы с протеомами: FASTA файл Acidothermus cellulolyticus 11B и FASTA файл Escherichia coli K12.