KEGG

1. На рисунке 1 представлена картинка референсного метаболического пути map00401.

map00401

Рисунок 1.

2. На рисунке 2 изображен фрагмент метаболического пути с выбранной мной реакцией, окрашенной в розовый цвет.

Фрагмент метаболического пути

Рисунок 2.

3. На рисунке 3 изображена схема выбранной мной реакции. Это реакция новобионовой кислоты (C12474) с dTDP-5-диметил-L-ликсозой (dTDP-4-О-деметил-бета-L-новиозой) (C12481), в результате которой образуются деметилдекарбамоилновобиоцин (C12475) и Дезокситимидин 5'-дифосфат (dTDP) (C00363).

Реакция

Рисунок 3.

4. Реакцию, представленную выше катализирует фермент L-диметилновиозил трансфераза; novM (имя гена); dTDP-бета-L-новиоза:новобионовая кислота 7-O-новиозилтрансфераза; L-новиозил трансфераза.
5. У данного фермента номер EC 2.4.1.302. Первая цифра "2" означает, что этот фермент относится к классу трансфераз. Втроая цифра "4" обозначет пренадлежность к подклассу гликозилтрансфераз. "1" - под-полкдасс гексозилтрансфераз. И последнее число "302" значит, что этот фермент L-диметилновиозил трансфераза.
6. На рисунке 4 предсталены метаболические пути Brucella suis 1330 (слева) и Aeropyrum pernix (справа).

00401

Рисунок 4.

7. У археи Aeropyrum pernix найдено 202 метаболических путя и 4772 гена.