Практикум 11

База данных reactome

Выданный мне список белков был проанализирован при помощи базы данных reactome. Эта база данных позволяет легко и приятно оценить функции данных ей на вход белков.

Сайт базы данных оказался достаточно user-friendly, и для проведения анализа мне потребовалось лишь загрузить файл с идентификаторами белков в окно.

Результат анализа выглядит так:

Теперь можно попробовать разобраться с этим! Честно, фигурки мне нравятся больше, чем палки, поэтому в дальнейшем я работала со следующей репрезентацией:

Вот теперь другое дело. Посмотрим внимательнее, где нашлись наши белочки.

В нашем списке оказалось несколько белков, связанных с клеточным циклом.

И несколько белков, связанных с передачей сигнала в ядре!

Внезапно, белки, связанные с локализацией белков в пероксисомах...

И, ура, что-то очень понятное! Много белков, связанных с метаболизмом липидов!

Reactome - очень милая база данных, мне понравилось.