Для выполнения данного практикума выберем 7 протеобактерий из списка при помощи генератора случайных чисел. С названиями можно ознакомиться в таблице 1.
Название | Мнемоника |
Escherichia coli | ECOLI |
Haemophilus influenzae | HAEIN |
Pseudomonas aeruginosa | PSEAE |
Pseudomonas mendocina | PSEMY |
Roseobacter denitrificans | ROSDO |
Saccharophagus degradans | SACD2 |
Yersinia pestis | YERPE |
Руководствусь приведённым ниже филогенетическим деревом, нарисуем дерево из выбранных организмов при помощи программы MEGA7.
((((YERPE, ECOLI), HAEIN), (SACD2, (PSEAE, PSEMY))), ROSDO);
Дерево содержит следующие нетривиальные ветви:
Все представленные в практикуме организмы являются протеобактериями. Таксономические различия представлены в таблице 2.
Класс | Порядок | Семейство | Вид |
γ-proteobacteria | Enterobacterales | Enterobacteriaceae | Escherichia coli |
Yersiniaceae | Yersinia pestis | ||
Pasteurellales | Pasteurellaceae | Haemophilus influenzae | |
Cellvibrionales | Cellvibrionaceae | Saccharophagus degradans | |
Pseudomonadales | Pseudomonadaceae | Pseudomonas aeruginosa | |
Pseudomonas mendocina | |||
α-proteobacteria | Rhodobacterales | Rhodobacteraceae | Roseobacter denitrificans |