Таблица с выбранными бактериями

Скобочная формула дерева

(ACICJ:15, ((PARDP:6, ROSDO:7):5, ((BARHE:7, BRUSU:6):3, (AGRFC:5, RHIME:4):5):5):3);

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит нетривиальные ветви:
1) {PARDP,ROSDO} против {ACICJ,BARHE,BRUSU,AGRFC,RHIME}
2) {PARDP,ROSDO,ACICJ} против {BARHE,BRUSU,AGRFC,RHIME}
3) {PARDP,ROSDO,ACICJ,BARHE,BRUSU} против {AGRFC,RHIME}
4) {PARDP,ROSDO,ACICJ,AGRFC,RHIME} против {BARHE,BRUSU}

- Ветвь {Bartonella henselae;Brucella suis} отноcятся к одному порядку Rhizobiales
-Ветвь {Agrobacterium fabrum;Rhizobium meliloti}: бактерии это ветви относятся к одному семейству Rhizobiaceae
- Ветвь {Paracoccus denitrificans;Roseobacter denitrificans}: бактерии этой ветви относятся к одному семеству Rhodobacteraceae
-Ветвь {Acidiphilium cryptum;Paracoccus denitrificans;Roseobacter denitrificans}: бактерии относятся к классу Alphaproteobacteria
- Ветвь {Agrobacterium fabrum;Bartonella henselae;Brucella suis;Rhizobium meliloti}: бактерии относятся к одному порядку  Rhizobiales

Построение и анализ дерева, содержащего паралоги

- использовалась программа MEGA, метод Maximum Parsimony



1) Паралоги: дупликация гена



2) Ортологи: разделение путей эволюции белков в результате видообразования

---

© Nenartovich Marina 2017