Участок структуры | Позиции в структуре (по результатам find_pair) | Результаты предсказания с помощью einverted | Результаты предсказания по алгоритму Зукера |
---|---|---|---|
Акцепторный стебель | >B:.901_:[PSU]P-**--A[..A]:.972_:B< >B:.902_:[..U]U-----A[..A]:.971_:B< >B:.903_:[..C]C-----G[..G]:.970_:B< >B:.904_:[..C]C-----G[..G]:.969_:B< >B:.905_:[..U]U-*---G[..G]:.968_:B< >B:.906_:[..C]C-----G[..G]:.967_:B< >B:.907_:[..G]G-----C[..C]:.966_:B< | совпали пять из семи | совпали шесть из семи |
D-стебель | >B:.910_:[2MG]g-----C[..C]:.925_:B< >B:.911_:[..C]C-----G[..G]:.924_:B< >B:.912_:[..C]C-----G[..G]:.923_:B< >B:.913_:[..C]C-**--C[..C]:.922_:B< | совпали два | совпали три из четырех |
T-стебель | >B:.949_:[5MC]c-----G[..G]:.965_:B< >B:.950_:[..C]C-----G[..G]:.964_:B< >B:.951_:[..A]A-----U[..U]:.963_:B< >B:.952_:[..G]G-----C[..C]:.962_:B< >B:.953_:[..G]G-----C[..C]:.961_:B< | 0 | предсказаны все |
Антикодоновый стебель | >B:.939_:[..C]C-----G[..G]:.931_:B< >B:.940_:[..C]C-----G[..G]:.930_:B< >B:.941_:[..A]A-----U[..U]:.929_:B< >B:.942_:[..G]G-----C[..C]:.928_:B< >B:.943_:[..A]A-**--P[PSU]:.927_:B< >B:.944_:[..A]A-*---g[M2G]:.926_:B< | 0 | Предсказаны пять из шести |
Общее число канонических пар нуклеотидов | 18 | 23 | 20 |
Контакты атомов белка (H-цепь) с | Полярные | Неполярные | Всего |
---|---|---|---|
остатками 2'-дезоксирибозы | 0 | 2 | 2 |
остатками фосфорной кислоты | 13 | 15 | 28 |
остатками азотистых оснований со стороны большой бороздки | 10 | 23 | 33 |
остатками азотистых оснований со стороны малой бороздки | 0 | 0 | 0 |
© Nenartovich Marina 2017