Карта локального сходства двух полипротеинов
изображение карты локального сходства
| Identities |
Positives |
length 1 (P03301) |
length 2 (P03306) |
Geps |
Score |
Score (bit) |
| 29% |
49% |
571 |
628 |
8% |
644 |
252 |
| 37% |
51% |
271 |
243 |
9% |
398 |
157 |
Зрелые белки в выравнивании с весом 644:
1) AC P03301: РНК-направленная РНК полимераза (RNA-directed RNA polymerase)
2) AC P03306: РНК-направленная РНК полимераза (RNA-directed RNA polymerase) 3D-POL
Зрелые белки в выравнивании с весом 398:
1) AC P03301: белок (Protein) 2C
2) AC P03306: белок (Protein) 2C
Сравнение веса выравнивания со случайным
| ID 1 |
ID 2 |
вес выравнивания |
медиана |
верхний квартиль |
вес в битах |
р-значение |
| 6PGL_BACSU |
6PGL_ECOLI |
317.0 |
50.0 |
55.75 |
72.2 |
1.84e-22 |
| LYTA_BACSU |
FADI_ECOLI |
25.0 |
30.0 |
34.75 |
-0.053 |
0.96 |
BLAST: поиск гомологов в банке
| ID X |
AC X |
Organism |
Identities |
Positives |
Length BAK10672.1 |
Length X |
Geps |
Score |
Score (bit) |
Expect |
Query cover |
| NOCT_AGRFC |
P35120 |
Agrobacterium fabrum |
43% |
60% |
236 |
238 |
1% |
560 |
220 |
8e-70 |
97% |
| OCCT_RHIRD |
P0A4F8 |
Rhizobium radiobacter |
42% |
58% |
232 |
233 |
4% |
537 |
211 |
2e-66 |
96% |