Царство:Bacteria
Тип: Proteobacteria
Класс: Beta Proteobacteria
Отряд: Burkholderiales
Семейство:Oxalobacteraceae
Род: Janthinobacterium
Бактерия Janthinobacterium sp. обитает в почве или воде (часто в болотистой почве). Ее особенностью является активное производство закиси азота. Это может быть связано с потерей некоторых генов, необходимых для нитрификации, в частности превращения связанного азота в молекулярный. При их отсутствии бактерия переходит на другой тип питания, а закись азота активно выделяется в атмоcферу.
Janthinobacterium также является патогеном шампиньона двуспорового (Agaricus bisporus), который является съедобным грибом и выращивается как товар для пищевой промышленности. С целью предотвращения массовых заражений гриба данной бактерией было начато ее изучение и секвенирование ее генома.
Запрос в Pubmed: Janthinobacterium sp. and genome
Идентификатор статьи в Pubmed: 22461541
Сатья в Pubmed Авторы: Kim SJ, Shin SC, Hong SG, Lee YM, Lee H, Lee J, Choi IG, Park H.
Аннотация:
The draft genome of Janthinobacterium sp. strain PAMC 25724, which is a violacein-producing psychrotolerant bacterium, was determined. The strain was isolated from glacier cryoconite of the Alps mountain permafrost region. The sequence will allow identification and characterization of the genetic determination of its cold-adaptive properties.
Другие источники: Исследование университета Хоккайдо и статья на Википедии.
У этой бактерии одна хромосома, данные о ней приведены в таблице ниже:
| Количество кодируемых белков | Тип | Количество пар оснований | Av. CDS Длина | GC-состав(ГЦ-состав) | Суммарная доля CDS | Количество генов |
| 3697 | Кольцевая | 4110251 | 993.82 | 54.2% | 89% | 3697 |
| Главная страница | Первый семестр | Второй семестр | Обо мне | Ссылки |