R.felis
Распределение длин белков
|
А.Мартынов
Введение.
Русское название бактерии Rickettsia felis - Риккетсия кошачья.
Таксономия:
Царство Bacteria
Тип Proteobacteria
Класс Alphaproteobacteria
Порядок Rickettsiales
Семейство Rickettsiaceae
Триба Rickettsieae
Род Rickettsia
Вид - Rickettsia felis
Длина бактерии 1-2 мкм, толщина 0.3-0.7 мкм.
Фотография скопирована со страницы http://ifr48.timone.univ-mrs.fr/Fiches/Rickettsia_felis.html,
подпись под этим рисунком: " R. felis в культуре на ячейках XTC-2. ".
Бактерия является внутриклеточным паразитом блох, млекопитающих и человека.
Переносится в основном Ctenocephalides felis (Кошачья Блоха).
Оптимальная температура роста: 28-32°С.
У человека вызывает сыпной тиф. До сих пор непонятно роль млекопитающих в жизненном цикле R.Felis.
Геном бактерии секвенирован для того, чтобы улучшить методы диагностики болезни, и разработки методов борьбы с ней.
Геном и протеом R.felis
Статистические данные о геноме приведены в табл.1 Они взяты с сайта http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html
Табл.1 Статистические данные о геноме R.felis
| Хромосома или плазмида |
Число пар нуклеотидов |
Число генов |
Суммарная длина генов (% от длины хромосомы или плазмиды) |
Суммарная длина межгенных промежутков (%) |
GC состав (%) |
| Хромосома (кольцевая) |
1 485 148 |
1 399 |
83.8% |
16.2% |
32.5% |
Плазмида pRF (кольцевая) |
62 829 |
68 |
81.0% |
19.0% |
33.6% |
Плазмида pRFdelta (кольцевая) |
39 263 |
44 |
81.1% |
18.9% |
33.2% |
Всего |
1 587 240 |
2 780 |
83.6% |
16.4% |
|
Литература
1. EBI - European Bioinformatics Institute:
http://www.ebi.ac.uk
2. Rickettsia felis as Emergent Global Threat for Humans - Carlos E. Perez-Osorio, Jorge E. Zavala-Velazquez, Juan Jose Arias Leon, and Jorge E. Zavala-Castro
(http://www.cdc.gov/eid/content/14/7/pdfs/1019.pdf)
3. Marseille maladies infectieuses - (http://ifr48.timone.univ-mrs.fr)
http://ifr48.timone.univ-mrs.fr/Fiches/Rickettsia_felis.html
|